微信小程序和支付宝小程序可以通用一个管理后台，但是小程序代码不能通用。因为微信小程序是基数微信aPP，支付宝小程序是基于支付宝app。
我们商城小程序系统是可以支持一个后台同时生成微信小程序和支付宝小程序。