小程序的注册方式包括小额打款和微信认证两种，具体如下：
1、小额打款。适用于未注册过小程序的邮箱，需要用公司的对公账户向腾讯公司打款来验证主体身份。打款信息在提交主体信息后可以查看到，按要求向指定的收款帐号汇入指定金额，完成汇款后，小程序部分功能可正常使用。
2、微信认证。因为需要支付300元认证费，认证通过前，小程序部分功能暂无法使用。
，小额打款和微信认证两种注册方式有所区别，可以根据需求和实际情况选择合适的方式进行注册。